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Hidenori Matsui

Fastaからcsv, csvからFastaへの変換

Fastaからcsvに書き出す、もしくはcsvをFastaとして書き出す必要がでてきました。

世の中にたくさんおられるpython使いの方々は「そんなの簡単でしょ?」とおっしゃられるかもしれませんが、どーにもpythonの敷居が高い私としては、Rでなんとかならんか?といろいろと悪戦苦闘しました。


そんな時に偶然見つけたのがFastaTabular。

Rを使い慣れた方であれば、サクサク利用できると思います。

作成者の方に感謝しかありません。

本当にありがとうございます。


スクリプトやリンクは下記から。


https://github.com/lrjoshi/FastaTabular



もうこれで、csv to fasta, fasta to csvは困りません。


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